|
|
Vraag gesteld door MarloesG op 05-02-2010Beste methodologiewinkel,
Ik heb een vraag over Kaplan Meier survival analyses. Ik wil bepalen wat de invloed van een bepaald eiwit is op de prognose van kankerpatienten. Hiervoor heb ik drie groepen met elkaar vergeleken: hoge expressie, matige expressie en geen expressie van het eiwit. De KM grafiek als geheel is niet significant. De hoge en matige expressie groep doen het namelijk allebei even slecht, maar in de geen expressie groep zijn er geen sterfgevallen. Deze geen expressie curve verschilt significant van hoog en matig wanneer je met compare pairwise de verschillen tussen de afzonderlijke grafieken bekijkt.
Nu is mijn vraag: welke conclusies mag ik hier uit deze resultaten trekken? NB: het samenvoegen van de hoog/matig groepen is geen optie
1. Mag ik zeggen dat de geen expressie groep het beter doet dan de andere twee, ondanks dat het plaatje als geheel niet significant is?
2. De geen expressie groep bevat minder patienten dan de andere twee groepen. Corrigeert de Log Rank test voor verschillen in groepsgrootte? Is er een minimum aantal patienten vereist in een groep om de Log Rank test te kunnen doen?
3. SPSS geeft een foutmelding (No statistics are computes, because all cases are censored) over de geen expressie groep waarin geen sterfgevallen zijn geweest. Heeft dit nog een betekenis? Antwoord gegeven door Gilles op 12-02-2010Hoi Marloes,
1.We begrijpen niet helemaal wat je bedoelt met: de KM grafiek als geheel is niet significant. We denken dat je hiermee de overall test statistics for ... factor bedoelt. Maar om hier iets zinnigs over te zeggen hebben we meer gegevens nodig. Je zou ons kunnen mailen hierover (wat je precies bedoelt + output) op methodol-fmg@uva.nl
2. Nee, de log rank test corrigeert daar niet voor. Maar verschillen in groepsgrootte vormen niet zo n groot probleem voor survival analysis tests. We weten niet precies hoeveel proefpersonen je nodig hebt in elke groep, maar we kennen wel voorbeelden met ongeveer 5 proefpersonen in elke groep.
3. We kunnen vanaf hier helaas niet in je output kijken, maar waarschijnlijk kan hij geen statistieken berekenen zoals de cumulative survival proportion omdat er gewoon niemand dood gaat (dus die survival proportion is bv dan gewoon 1).
groeten Manon en Noemi
|
uitleg
Bij de methodologiewinkel kunt u terecht met vragen van statistische en methodologische aard.
U dient eerst een gebruikersnaam en
wachtwoord aan te maken. Daarna gaat u naar 'stel een vraag'.
De vragen worden beantwoord door studenten met een uitgebreide statistische
en methodologische achtergrond.
inloggen
Wachtwoord vergeten? Laat uw gebruikersnaam en wachtwoord
per email versturen.
|
